Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLF1Q13351 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
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