Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CHAF1AQ13111 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHAF1AQ13111 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHAF1AQ13111 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
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