Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT88Q13099 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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