Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK3Q13003 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIK3Q13003 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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