Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 SIT1YEL065W 1887 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 CDS1YBR029C 1374 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 CPS1YJL172W 1731 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 RTC5YOR118W 1704 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 SFI1YLL003W 2841 nt5.51□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 TAF5YBR198C 2397 nt5.5□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 VID22YLR373C 2706 nt5.5□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 NOP16YER002W 696 nt5.5□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 MNN11YJL183W 1269 nt5.5□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.5□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 BUD28YLR062C 378 nt5.5□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 YMR147WYMR147W 672 nt5.5□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 YIM1YMR152W 1098 nt5.5□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 AST1YBL069W 1290 nt5.5□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 CSL4YNL232W 879 nt5.5□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 BBP1YPL255W 1158 nt5.5□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 MSC7YHR039C 1935 nt5.5□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 PEP5YMR231W 3090 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 BRL1YHR036W 1416 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 TEA1YOR337W 2280 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 GMC1YDR506C 1827 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 LUC7YDL087C 786 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 YDL172CYDL172C 480 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 CPR6YLR216C 1116 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 YNL247WYNL247W 2304 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 KAP114YGL241W 3015 nt5.49□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 RAD28YDR030C 1521 nt5.48□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 TAF11YML015C 1041 nt5.48□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 RCK2YLR248W 1833 nt5.48□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 CYM1YDR430C 2970 nt5.48□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 GPR1YDL035C 2886 nt5.48□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 FAA3YIL009W 2085 nt5.47□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 GDB1YPR184W 4611 nt5.47□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 DOA1YKL213C 2148 nt5.47□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 NOP7YGR103W 1818 nt5.47□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 SCS2YER120W 735 nt5.47□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 PDE1YGL248W 1110 nt5.47□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 NAT2YGR147C 867 nt5.47□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 BUD17YNR027W 954 nt5.47□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 SEC18YBR080C 2277 nt5.47□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 CNM67YNL225C 1746 nt5.47□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 YJR015WYJR015W 1533 nt5.47□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 FUM1YPL262W 1467 nt5.46□□□□□ -1.53
LSP1Q12230 HNT2YDR305C 654 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 RIP1YEL024W 648 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YFL068WYFL068W 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 JJJ3YJR097W 519 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YJU2YKL095W 837 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 CDC21YOR074C 915 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 ATH1YPR026W 3636 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 KGD1YIL125W 3045 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YMR196WYMR196W 3267 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 APM1YPL259C 1428 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 SSB2YNL209W 1842 nt5.46□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 VID30YGL227W 2877 nt5.45□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 RAD30YDR419W 1899 nt5.45□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 DPB2YPR175W 2070 nt5.45□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 MLC1YGL106W 450 nt5.45□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YNL194CYNL194C 906 nt5.45□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 YER158CYER158C 1722 nt5.45□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 VHS2YIL135C 1311 nt5.45□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 NUP2YLR335W 2163 nt5.45□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 AIM17YHL021C 1398 nt5.44□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 TVP38YKR088C 1014 nt5.44□□□□□ -1.54
LSP1Q12230 SLZ1YNL196C 897 nt5.44□□□□□ -1.54
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