Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 CPR2YHR057C 618 nt8.29□□□□□ -1.08
NCR1Q12200 YJL049WYJL049W 1353 nt8.29□□□□□ -1.08
NCR1Q12200 RAD55YDR076W 1221 nt8.28□□□□□ -1.08
NCR1Q12200 CTH1YDR151C 978 nt8.28□□□□□ -1.08
NCR1Q12200 DST1YGL043W 930 nt8.28□□□□□ -1.08
NCR1Q12200 YGR290WYGR290W 444 nt8.28□□□□□ -1.08
NCR1Q12200 YAR047CYAR047C 321 nt8.28□□□□□ -1.08
NCR1Q12200 YLR217WYLR217W 324 nt8.28□□□□□ -1.08
NCR1Q12200 PRP19YLL036C 1512 nt8.28□□□□□ -1.08
NCR1Q12200 ACA1YER045C 1470 nt8.27□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 PLP1YDR183W 693 nt8.27□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 YGR126WYGR126W 693 nt8.27□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 VMA16YHR026W 642 nt8.27□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 PIH1YHR034C 1035 nt8.27□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 TDA4YJR116W 840 nt8.27□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 GCD7YLR291C 1146 nt8.27□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 PTH2YBL057C 627 nt8.27□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 ADH6YMR318C 1083 nt8.27□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 ARF3YOR094W 552 nt8.27□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 LPD1YFL018C 1500 nt8.27□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 RRP43YCR035C 1185 nt8.26□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 GCN4YEL009C 846 nt8.26□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt8.26□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 GPI12YMR281W 915 nt8.26□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 MPD1YOR288C 957 nt8.26□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 YDR387CYDR387C 1668 nt8.26□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 NDE2YDL085W 1638 nt8.25□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 RRP42YDL111C 798 nt8.25□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 RPL27BYDR471W 411 nt8.25□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 PUP2YGR253C 783 nt8.25□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 MRPL22YNL177C 930 nt8.25□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 YOL160WYOL160W 342 nt8.25□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 FYV12YOR183W 390 nt8.25□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 TGL5YOR081C 2250 nt8.25□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 STE3YKL178C 1413 nt8.25□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 CUE2YKL090W 1332 nt8.25□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 SLT2YHR030C 1455 nt8.25□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 SES1YDR023W 1389 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 MDM34YGL219C 1380 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 snR8snR8 190 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 AAD6YFL056C 639 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 DOC1YGL240W 753 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 YGR122WYGR122W 1209 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 SNP1YIL061C 903 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 GCV3YAL044C 513 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 SPC3YLR066W 555 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 RFU1YLR073C 603 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 YLR312CYLR312C 1197 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 MRPL3YMR024W 1173 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 YOR292CYOR292C 930 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt8.24□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 DPB2YPR175W 2070 nt8.23□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 FIT1YDR534C 1587 nt8.23□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 RMD6YEL072W 696 nt8.23□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 VFA1YER128W 612 nt8.23□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 RPN12YFR052W 825 nt8.23□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 COS12YGL263W 1143 nt8.23□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 COS9YKL219W 1224 nt8.23□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 ELP6YMR312W 822 nt8.23□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 RER2YBR002C 861 nt8.23□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 YDR514CYDR514C 1452 nt8.23□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 YNL295WYNL295W 1575 nt8.22□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 VTS1YOR359W 1572 nt8.22□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 IME4YGL192W 1803 nt8.22□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 PET112YBL080C 1626 nt8.22□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 YDL050CYDL050C 372 nt8.22□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 FMP33YJL161W 543 nt8.22□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 SML1YML058W 315 nt8.22□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 ATP23YNR020C 813 nt8.22□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 ERV2YPR037C 591 nt8.22□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 RFC5YBR087W 1065 nt8.22□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 SPS2YDR522C 1509 nt8.22□□□□□ -1.09
NCR1Q12200 PRM10YJL108C 1152 nt8.21□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 VPS51YKR020W 495 nt8.21□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 RPL40BYKR094C 387 nt8.21□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 YMR087WYMR087W 855 nt8.21□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 YOL118CYOL118C 309 nt8.21□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 snR63snR63 255 nt8.2□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 YGR293CYGR293C 462 nt8.2□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 YJR141WYJR141W 1044 nt8.2□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 YLR125WYLR125W 411 nt8.2□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 YAF9YNL107W 681 nt8.2□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 RET3YPL010W 570 nt8.2□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 LEE1YPL054W 906 nt8.2□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 YBR300CYBR300C 498 nt8.2□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 VHS1YDR247W 1386 nt8.2□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 GDS1YOR355W 1569 nt8.19□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 YOS9YDR057W 1629 nt8.19□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 TIM22YDL217C 624 nt8.19□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 YDR114CYDR114C 303 nt8.19□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 THP2YHR167W 786 nt8.19□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 YJL169WYJL169W 369 nt8.19□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 CMC2YBL059C-A 330 nt8.19□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 IZH2YOL002C 954 nt8.19□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 LIP5YOR196C 1245 nt8.19□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 HEM14YER014W 1620 nt8.18□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 FRA1YLL029W 2250 nt8.18□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.18□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.18□□□□□ -1.1
NCR1Q12200 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.18□□□□□ -1.1
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