Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 MRL1YPR079W 1146 nt4.67□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 FRS1YLR060W 1788 nt4.67□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 GAL10YBR019C 2100 nt4.67□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 TSL1YML100W 3297 nt4.67□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 SIS2YKR072C 1689 nt4.67□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 AVT3YKL146W 2079 nt4.66□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 LEU1YGL009C 2340 nt4.66□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 PRS2YER099C 957 nt4.66□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 ECM19YLR390W 339 nt4.66□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 SWP1YMR149W 861 nt4.66□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 CBP3YPL215W 1008 nt4.66□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 MAK3YPR051W 531 nt4.66□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 ISR1YPR106W 1332 nt4.66□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 KIC1YHR102W 3243 nt4.66□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 LCB2YDR062W 1686 nt4.65□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 TIF4632YGL049C 2745 nt4.65□□□□□ -1.66
MSH5Q12175 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 ERP5YHR110W 639 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 SPO7YAL009W 780 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 ARC40YBR234C 1155 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 HRK1YOR267C 2280 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 MPH2YDL247W 1830 nt4.65□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 ALG2YGL065C 1512 nt4.64□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 PMP3YDR276C 168 nt4.64□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 THI5YFL058W 1023 nt4.64□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 YGR122WYGR122W 1209 nt4.64□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.64□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 SPS18YNL204C 903 nt4.64□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 THI12YNL332W 1023 nt4.64□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 SAC1YKL212W 1872 nt4.64□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 HIR2YOR038C 2628 nt4.63□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 PCL8YPL219W 1479 nt4.63□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 EGT2YNL327W 3126 nt4.63□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 FRE7YOL152W 1863 nt4.63□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 TFG1YGR186W 2208 nt4.63□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 COS9YKL219W 1224 nt4.63□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 GPI12YMR281W 915 nt4.63□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 YNL194CYNL194C 906 nt4.63□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 ATR1YML116W 1629 nt4.63□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 ASA1YPR085C 1332 nt4.63□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 CTT1YGR088W 1689 nt4.63□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 HMLALPHA1YCL066W 528 nt4.62□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 MATALPHA1YCR040W 528 nt4.62□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 YHR140WYHR140W 720 nt4.62□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 ZRT2YLR130C 1269 nt4.62□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 SFT2YBL102W 648 nt4.62□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 SMA1YPL027W 738 nt4.62□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.62□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 RFT1YBL020W 1725 nt4.62□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 SKG6YHR149C 2205 nt4.62□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 TOS4YLR183C 1470 nt4.62□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 TPO2YGR138C 1845 nt4.61□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.61□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 CAD1YDR423C 1230 nt4.61□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 GLE2YER107C 1098 nt4.61□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 RPB4YJL140W 666 nt4.61□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 YLR126CYLR126C 756 nt4.61□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 MTF1YMR228W 1026 nt4.61□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 TOM7YNL070W 183 nt4.61□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 RER2YBR002C 861 nt4.61□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 MED4YOR174W 855 nt4.61□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 POP4YBR257W 840 nt4.61□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 RVB1YDR190C 1392 nt4.61□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 PRD1YCL057W 2139 nt4.61□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 UBP7YIL156W 3216 nt4.6□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 NUP2YLR335W 2163 nt4.6□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 HST4YDR191W 1113 nt4.6□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 YGR153WYGR153W 654 nt4.6□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 PRE3YJL001W 648 nt4.6□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 GSP2YOR185C 663 nt4.6□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 FPK1YNR047W 2682 nt4.6□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 CDC10YCR002C 969 nt4.59□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 GSY1YFR015C 2127 nt4.59□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 COQ6YGR255C 1440 nt4.59□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 FUN19YAL034C 1242 nt4.59□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 TGL4YKR089C 2733 nt4.59□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 TDA5YLR426W 981 nt4.59□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 LST8YNL006W 912 nt4.59□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.59□□□□□ -1.67
MSH5Q12175 PRP40YKL012W 1752 nt4.58□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 MET3YJR010W 1536 nt4.58□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 RIP1YEL024W 648 nt4.58□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 HFA1YMR207C 6372 nt4.58□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 ELC1YPL046C 300 nt4.58□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 CDC48YDL126C 2508 nt4.57□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 SEN1YLR430W 6696 nt4.57□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 TVP38YKR088C 1014 nt4.57□□□□□ -1.68
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