Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB3Q04118 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms