Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFHR1Q03591 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms