Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NHLH1Q02575 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NHLH1Q02575 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms