Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL18AQ02543 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms