Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DSC2Q02487 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms