Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 BAP2YBR068C 1830 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 DBF4YDR052C 2115 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 SAP155YFR040W 3009 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 ARP2YDL029W 1176 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 PCL9YDL179W 915 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 ERV14YGL054C 417 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 TFS1YLR178C 660 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 HCR1YLR192C 798 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 YLR194CYLR194C 765 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 PGA2YNL149C 390 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 AIM41YOR215C 558 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 ARG4YHR018C 1392 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 MKS1YNL076W 1755 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 PRM7YDL039C 2097 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 ELP2YGR200C 2367 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 NOT3YIL038C 2511 nt4.72□□□□□ -1.65
SKO1Q02100 RRN3YKL125W 1884 nt4.71□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 SUM1YDR310C 3189 nt4.71□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 COX26YDR119W-A 201 nt4.71□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 CAX4YGR036C 720 nt4.71□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 DBR1YKL149C 1218 nt4.71□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.71□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 KRS1YDR037W 1776 nt4.7□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 BDP1YNL039W 1785 nt4.7□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 MIF2YKL089W 1650 nt4.7□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 GAS2YLR343W 1668 nt4.7□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 TMN2YDR107C 2019 nt4.7□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 RTT106YNL206C 1368 nt4.7□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 MLC1YGL106W 450 nt4.7□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 YGR066CYGR066C 879 nt4.7□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 YMR082CYMR082C 357 nt4.7□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 YBR139WYBR139W 1527 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 snR57snR57 88 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 PEX19YDL065C 1029 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 LSM6YDR378C 261 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 PCT1YGR202C 1275 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 YPR015CYPR015C 744 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 ANT1YPR128C 987 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 AIM10YER087W 1731 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 FUM1YPL262W 1467 nt4.69□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 GLO2YDR272W 825 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 COS4YFL062W 1140 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 YFL064CYFL064C 525 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 TIM21YGR033C 720 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 YGR273CYGR273C 525 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 LNP1YHR192W 837 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 PGA3YML125C 939 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 COS3YML132W 1140 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 MFA2YNL145W 117 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 OAZ1YPL052W 879 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 YPR202WYPR202W 717 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 CKS1YBR135W 453 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 COS2YBR302C 1140 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 BLM10YFL007W 6432 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 SLT2YHR030C 1455 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 BIT2YBR270C 1638 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 DAK1YML070W 1755 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 TRK2YKR050W 2670 nt4.68□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 SHE10YGL228W 1734 nt4.67□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 TPS3YMR261C 3165 nt4.67□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 CNL1YDR357C 369 nt4.67□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 CAF16YFL028C 870 nt4.67□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 MND2YIR025W 1107 nt4.67□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 PRS1YKL181W 1284 nt4.67□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 COS9YKL219W 1224 nt4.67□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 YLR118CYLR118C 684 nt4.67□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.67□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 RIM15YFL033C 5313 nt4.67□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 SSZ1YHR064C 1617 nt4.67□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 TEA1YOR337W 2280 nt4.67□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 RFT1YBL020W 1725 nt4.66□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 YDL034WYDL034W 345 nt4.66□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 KNH1YDL049C 807 nt4.66□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 GCS1YDL226C 1059 nt4.66□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 CIA2YHR122W 696 nt4.66□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 MRPL13YKR006C 795 nt4.66□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 CTR1YPR124W 1221 nt4.66□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 NAT3YPR131C 588 nt4.66□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 MOT2YER068W 1764 nt4.65□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 PHO90YJL198W 2646 nt4.65□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 TIM54YJL054W 1437 nt4.65□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 YDR444WYDR444W 2064 nt4.65□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 GAS5YOL030W 1455 nt4.65□□□□□ -1.66
SKO1Q02100 YER085CYER085C 522 nt4.65□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.65□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YGL118CYGL118C 438 nt4.65□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 CDC43YGL155W 1131 nt4.65□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms