Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
XPCQ01831 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
XPCQ01831 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
XPCQ01831 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
XPCQ01831 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
XPCQ01831 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
XPCQ01831 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
XPCQ01831 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
XPCQ01831 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
XPCQ01831 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
XPCQ01831 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
XPCQ01831 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
XPCQ01831 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
XPCQ01831 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
XPCQ01831 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
XPCQ01831 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
XPCQ01831 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
XPCQ01831 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
XPCQ01831 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
XPCQ01831 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
XPCQ01831 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
XPCQ01831 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
XPCQ01831 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
XPCQ01831 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
XPCQ01831 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
XPCQ01831 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
XPCQ01831 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
XPCQ01831 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
XPCQ01831 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
XPCQ01831 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
XPCQ01831 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
XPCQ01831 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
XPCQ01831 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
XPCQ01831 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
XPCQ01831 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
XPCQ01831 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
XPCQ01831 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
XPCQ01831 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
XPCQ01831 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
XPCQ01831 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
XPCQ01831 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
XPCQ01831 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
XPCQ01831 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
XPCQ01831 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
XPCQ01831 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
XPCQ01831 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
XPCQ01831 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
XPCQ01831 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
XPCQ01831 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
XPCQ01831 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
XPCQ01831 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
XPCQ01831 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
XPCQ01831 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
XPCQ01831 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
XPCQ01831 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
XPCQ01831 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
XPCQ01831 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
XPCQ01831 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
XPCQ01831 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
XPCQ01831 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
XPCQ01831 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
XPCQ01831 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
XPCQ01831 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
XPCQ01831 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
XPCQ01831 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
XPCQ01831 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
XPCQ01831 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
XPCQ01831 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
XPCQ01831 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
XPCQ01831 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
XPCQ01831 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
XPCQ01831 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
XPCQ01831 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
XPCQ01831 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
XPCQ01831 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
XPCQ01831 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
XPCQ01831 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
XPCQ01831 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
XPCQ01831 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
XPCQ01831 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
XPCQ01831 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
XPCQ01831 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
XPCQ01831 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
XPCQ01831 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
XPCQ01831 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms