Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK17Q00537 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK17Q00537 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms