Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms