Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVFC1-1P60608 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms