Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CTSWP56202 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTSWP56202 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTSWP56202 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTSWP56202 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CTSWP56202 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTSWP56202 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTSWP56202 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTSWP56202 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTSWP56202 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CTSWP56202 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTSWP56202 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTSWP56202 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTSWP56202 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CTSWP56202 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTSWP56202 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTSWP56202 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTSWP56202 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTSWP56202 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CTSWP56202 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTSWP56202 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTSWP56202 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSWP56202 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSWP56202 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSWP56202 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSWP56202 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSWP56202 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSWP56202 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSWP56202 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSWP56202 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSWP56202 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTSWP56202 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTSWP56202 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTSWP56202 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTSWP56202 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTSWP56202 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTSWP56202 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTSWP56202 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTSWP56202 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTSWP56202 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTSWP56202 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTSWP56202 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTSWP56202 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTSWP56202 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTSWP56202 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTSWP56202 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTSWP56202 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTSWP56202 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTSWP56202 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTSWP56202 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CTSWP56202 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CTSWP56202 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CTSWP56202 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTSWP56202 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTSWP56202 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTSWP56202 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTSWP56202 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTSWP56202 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTSWP56202 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CTSWP56202 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTSWP56202 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTSWP56202 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTSWP56202 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTSWP56202 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSWP56202 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSWP56202 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSWP56202 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSWP56202 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSWP56202 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSWP56202 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSWP56202 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSWP56202 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSWP56202 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSWP56202 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSWP56202 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTSWP56202 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTSWP56202 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTSWP56202 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTSWP56202 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTSWP56202 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CTSWP56202 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CTSWP56202 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTSWP56202 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTSWP56202 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTSWP56202 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTSWP56202 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTSWP56202 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms