Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC13P55735 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC13P55735 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC13P55735 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC13P55735 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC13P55735 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC13P55735 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC13P55735 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC13P55735 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC13P55735 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC13P55735 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC13P55735 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC13P55735 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC13P55735 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC13P55735 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC13P55735 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC13P55735 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC13P55735 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC13P55735 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC13P55735 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC13P55735 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC13P55735 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC13P55735 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC13P55735 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC13P55735 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC13P55735 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC13P55735 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC13P55735 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC13P55735 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC13P55735 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC13P55735 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC13P55735 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC13P55735 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC13P55735 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC13P55735 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC13P55735 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC13P55735 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC13P55735 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC13P55735 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC13P55735 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC13P55735 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC13P55735 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC13P55735 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC13P55735 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC13P55735 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC13P55735 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC13P55735 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC13P55735 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC13P55735 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC13P55735 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC13P55735 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC13P55735 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC13P55735 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC13P55735 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC13P55735 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC13P55735 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC13P55735 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC13P55735 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC13P55735 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC13P55735 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC13P55735 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC13P55735 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC13P55735 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC13P55735 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC13P55735 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC13P55735 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC13P55735 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC13P55735 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC13P55735 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC13P55735 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC13P55735 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC13P55735 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC13P55735 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC13P55735 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC13P55735 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC13P55735 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC13P55735 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC13P55735 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC13P55735 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC13P55735 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC13P55735 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC13P55735 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC13P55735 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC13P55735 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC13P55735 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms