Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH8P55286 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH8P55286 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH8P55286 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH8P55286 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH8P55286 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH8P55286 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH8P55286 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH8P55286 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH8P55286 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH8P55286 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH8P55286 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH8P55286 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH8P55286 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH8P55286 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH8P55286 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH8P55286 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH8P55286 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH8P55286 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH8P55286 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH8P55286 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH8P55286 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH8P55286 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH8P55286 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH8P55286 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH8P55286 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH8P55286 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH8P55286 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH8P55286 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH8P55286 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH8P55286 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH8P55286 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH8P55286 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH8P55286 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH8P55286 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH8P55286 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH8P55286 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH8P55286 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH8P55286 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH8P55286 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH8P55286 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH8P55286 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH8P55286 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH8P55286 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH8P55286 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH8P55286 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH8P55286 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH8P55286 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH8P55286 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH8P55286 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH8P55286 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH8P55286 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH8P55286 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH8P55286 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH8P55286 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH8P55286 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH8P55286 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH8P55286 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH8P55286 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH8P55286 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH8P55286 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH8P55286 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH8P55286 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH8P55286 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH8P55286 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH8P55286 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH8P55286 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH8P55286 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH8P55286 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH8P55286 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH8P55286 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH8P55286 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH8P55286 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH8P55286 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH8P55286 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH8P55286 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH8P55286 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH8P55286 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH8P55286 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH8P55286 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH8P55286 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH8P55286 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH8P55286 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH8P55286 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms