Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
BRPF1P55201 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRPF1P55201 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms