Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHBP55084 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHBP55084 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHBP55084 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHBP55084 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHBP55084 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHBP55084 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HADHBP55084 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHBP55084 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHBP55084 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHBP55084 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHBP55084 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHBP55084 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHBP55084 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHBP55084 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HADHBP55084 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HADHBP55084 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HADHBP55084 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HADHBP55084 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHBP55084 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHBP55084 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHBP55084 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HADHBP55084 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHBP55084 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHBP55084 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHBP55084 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHBP55084 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHBP55084 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHBP55084 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHBP55084 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHBP55084 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHBP55084 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHBP55084 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HADHBP55084 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHBP55084 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHBP55084 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHBP55084 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHBP55084 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHBP55084 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHBP55084 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HADHBP55084 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHBP55084 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHBP55084 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHBP55084 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHBP55084 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHBP55084 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHBP55084 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHBP55084 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HADHBP55084 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHBP55084 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHBP55084 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHBP55084 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHBP55084 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHBP55084 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HADHBP55084 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHBP55084 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHBP55084 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHBP55084 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHBP55084 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHBP55084 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHBP55084 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHBP55084 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHBP55084 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHBP55084 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHBP55084 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHBP55084 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHBP55084 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HADHBP55084 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HADHBP55084 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HADHBP55084 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HADHBP55084 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HADHBP55084 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HADHBP55084 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HADHBP55084 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HADHBP55084 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHBP55084 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHBP55084 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHBP55084 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHBP55084 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHBP55084 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHBP55084 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHBP55084 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HADHBP55084 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms