Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLTPP55058 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLTPP55058 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLTPP55058 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PLTPP55058 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLTPP55058 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLTPP55058 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLTPP55058 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLTPP55058 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLTPP55058 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLTPP55058 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLTPP55058 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLTPP55058 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLTPP55058 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLTPP55058 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLTPP55058 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PLTPP55058 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLTPP55058 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLTPP55058 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLTPP55058 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLTPP55058 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLTPP55058 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLTPP55058 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLTPP55058 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLTPP55058 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLTPP55058 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLTPP55058 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLTPP55058 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLTPP55058 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLTPP55058 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLTPP55058 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLTPP55058 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLTPP55058 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLTPP55058 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLTPP55058 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLTPP55058 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLTPP55058 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLTPP55058 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLTPP55058 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLTPP55058 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLTPP55058 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PLTPP55058 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLTPP55058 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLTPP55058 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLTPP55058 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLTPP55058 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLTPP55058 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLTPP55058 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLTPP55058 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLTPP55058 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLTPP55058 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLTPP55058 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLTPP55058 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLTPP55058 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLTPP55058 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLTPP55058 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLTPP55058 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLTPP55058 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PLTPP55058 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLTPP55058 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLTPP55058 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLTPP55058 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLTPP55058 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLTPP55058 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLTPP55058 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PLTPP55058 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLTPP55058 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLTPP55058 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLTPP55058 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLTPP55058 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLTPP55058 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLTPP55058 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLTPP55058 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLTPP55058 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLTPP55058 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLTPP55058 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLTPP55058 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLTPP55058 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLTPP55058 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLTPP55058 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLTPP55058 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLTPP55058 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLTPP55058 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLTPP55058 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLTPP55058 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLTPP55058 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLTPP55058 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLTPP55058 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLTPP55058 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLTPP55058 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLTPP55058 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLTPP55058 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLTPP55058 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLTPP55058 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLTPP55058 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLTPP55058 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLTPP55058 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLTPP55058 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLTPP55058 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLTPP55058 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms