Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D1P54289 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms