Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRISP3P54108 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRISP3P54108 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CRISP3P54108 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRISP3P54108 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRISP3P54108 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRISP3P54108 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRISP3P54108 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRISP3P54108 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRISP3P54108 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRISP3P54108 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP3P54108 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP3P54108 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP3P54108 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRISP3P54108 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP3P54108 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP3P54108 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP3P54108 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP3P54108 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP3P54108 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP3P54108 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP3P54108 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP3P54108 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP3P54108 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP3P54108 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP3P54108 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP3P54108 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP3P54108 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP3P54108 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP3P54108 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP3P54108 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRISP3P54108 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP3P54108 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP3P54108 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP3P54108 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP3P54108 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP3P54108 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP3P54108 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP3P54108 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP3P54108 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP3P54108 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP3P54108 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP3P54108 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP3P54108 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms