Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2KP53803 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms