Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCNKBP51801 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCNKBP51801 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCNKBP51801 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms