Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D1P51668 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms