Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
SMARCA2P51531 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC41.35■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
SMARCA2P51531 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms