Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VEGFBP49765 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VEGFBP49765 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms