Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 CCNY-204ENST00000374706 3940 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 46
AARSP49588 CCNY-208ENST00000492478 809 ntTSL 59.61□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 46
AARSP49588 NCOR2-207ENST00000420698 1752 ntTSL 217.97■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 46
AARSP49588 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.251e-6■■■■■ 45.8
AARSP49588 TNK2-216ENST00000468819 876 ntTSL 1 (best)22.06■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 45.8
AARSP49588 ACSL4-206ENST00000502391 802 ntTSL 322.47■■□□□ 1.196e-6■■■■■ 45.1
AARSP49588 ACSL4-211ENST00000508092 637 ntTSL 420.23■□□□□ 0.836e-6■■■■■ 45.1
AARSP49588 ACSL4-208ENST00000504980 573 ntTSL 418.35■□□□□ 0.536e-6■■■■■ 45.1
AARSP49588 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.466e-6■■■■■ 45.1
AARSP49588 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 45.1
AARSP49588 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.196e-6■■■■■ 45.1
AARSP49588 ACSL4-205ENST00000469857 506 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.556e-6■■■■■ 45.1
AARSP49588 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.26e-6■■■■■ 45.1
AARSP49588 ACSL4-210ENST00000505855 587 ntTSL 44.74□□□□□ -1.656e-6■■■■■ 45.1
AARSP49588 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 45
AARSP49588 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.579e-7■■■■■ 44.9
AARSP49588 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)24.3■■□□□ 1.489e-7■■■■■ 44.9
AARSP49588 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.059e-7■■■■■ 44.9
AARSP49588 PI4KA-207ENST00000466772 3109 ntTSL 216.12■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 44.8
AARSP49588 PI4KA-209ENST00000477245 3026 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 44.8
AARSP49588 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 44.8
AARSP49588 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 39.02□□□□□ -0.979e-7■■■■■ 44.8
AARSP49588 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 44.6
AARSP49588 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 44.6
AARSP49588 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 44.6
AARSP49588 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 512.8□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 44.6
AARSP49588 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.225e-6■■■■■ 44.5
AARSP49588 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 321.19■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 44.4
AARSP49588 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 14e-6■■■■■ 44.2
AARSP49588 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.914e-6■■■■■ 44.2
AARSP49588 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.744e-6■■■■■ 44.2
AARSP49588 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.364e-6■■■■■ 44.2
AARSP49588 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.82e-6■■■■■ 44.2
AARSP49588 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 44.2
AARSP49588 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 44.2
AARSP49588 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 44.2
AARSP49588 BCR-207ENST00000463770 168 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 44
AARSP49588 BCR-212ENST00000479188 658 ntTSL 414.68□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 44
AARSP49588 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 43.9
AARSP49588 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 43.9
AARSP49588 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 43.9
AARSP49588 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 11e-6■■■■■ 43.8
AARSP49588 LINC00963-205ENST00000444184 1887 ntTSL 1 (best)20.71■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 43.8
AARSP49588 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 43.8
AARSP49588 ARHGAP22-215ENST00000515523 496 ntTSL 414.3□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 43.8
AARSP49588 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.712e-6■■■■■ 43.7
AARSP49588 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 43.7
AARSP49588 GNPTG-205ENST00000527168 1317 ntTSL 525.18■■□□□ 1.627e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.487e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 GNPTG-208ENST00000529957 922 ntTSL 523.98■■□□□ 1.437e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 GNPTG-209ENST00000534197 420 ntTSL 323.98■■□□□ 1.437e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 GNPTG-206ENST00000527876 550 ntTSL 423.8■■□□□ 1.47e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 GNPTG-207ENST00000529110 552 ntTSL 223.79■■□□□ 1.47e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 PPT2-EGFL8-207ENST00000585246 1051 ntAPPRIS ALT2 TSL 223.23■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 43.7
AARSP49588 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.217e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.217e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.137e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 ARFRP1-211ENST00000618568 1612 ntTSL 322.1■■□□□ 1.137e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 EGFL8-221ENST00000432129 825 ntTSL 521.9■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 43.7
AARSP49588 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.087e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.027e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.987e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.977e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 GNPTG-202ENST00000526820 572 ntTSL 320.95■□□□□ 0.947e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.937e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 PPT2-EGFL8-201ENST00000421600 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.05■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 43.7
AARSP49588 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.797e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.787e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.767e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.747e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.697e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 PPT2-EGFL8-206ENST00000583227 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.9■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 43.7
AARSP49588 PPT2-EGFL8-204ENST00000453656 1327 ntTSL 218.54■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 43.7
AARSP49588 C19orf25-211ENST00000592486 2314 nt18.43■□□□□ 0.547e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.527e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 PPT2-EGFL8-203ENST00000428388 2878 ntAPPRIS P5 TSL 218.2■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 43.7
AARSP49588 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.217e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.057e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 C19orf25-209ENST00000590621 885 ntTSL 314.82□□□□□ -0.047e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 43.7
AARSP49588 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 212.27□□□□□ -0.457e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 MFN2-201ENST00000235329 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.57e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 PPT2-EGFL8-205ENST00000479001 944 ntTSL 511.25□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 43.7
AARSP49588 DNTTIP1-206ENST00000467701 502 ntTSL 510.93□□□□□ -0.667e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 GS1-600G8.3-201ENST00000431486 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.87e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.047e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 38.02□□□□□ -1.137e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.137e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.137e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.157e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.267e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 PNN-204ENST00000554902 583 ntTSL 24.78□□□□□ -1.649e-13■■■■■ 43.7
AARSP49588 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.177e-9■■■■■ 43.7
AARSP49588 ARHGAP4-224ENST00000494813 1939 ntTSL 523.42■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 43.5
AARSP49588 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.632e-6■■■■■ 43.3
AARSP49588 ACSS2-205ENST00000467019 504 ntTSL 423.32■■□□□ 1.324e-6■■■■■ 42.9
AARSP49588 ACSS2-213ENST00000480978 844 ntTSL 222.58■■□□□ 1.214e-6■■■■■ 42.9
AARSP49588 ACSS2-211ENST00000477932 2450 ntTSL 522.53■■□□□ 1.24e-6■■■■■ 42.9
AARSP49588 ACSS2-222ENST00000493805 603 ntTSL 421.72■■□□□ 1.074e-6■■■■■ 42.9
AARSP49588 ACSS2-208ENST00000473172 665 ntTSL 321.22■□□□□ 0.994e-6■■■■■ 42.9
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