Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
MARCKSL1P49006 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MARCKSL1P49006 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms