Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRXP46100 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRXP46100 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRXP46100 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRXP46100 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRXP46100 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRXP46100 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRXP46100 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRXP46100 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRXP46100 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRXP46100 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRXP46100 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRXP46100 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRXP46100 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRXP46100 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRXP46100 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRXP46100 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRXP46100 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRXP46100 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRXP46100 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRXP46100 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRXP46100 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRXP46100 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRXP46100 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRXP46100 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRXP46100 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRXP46100 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRXP46100 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRXP46100 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRXP46100 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRXP46100 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRXP46100 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRXP46100 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRXP46100 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRXP46100 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRXP46100 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRXP46100 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRXP46100 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRXP46100 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRXP46100 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRXP46100 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRXP46100 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRXP46100 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRXP46100 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRXP46100 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRXP46100 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRXP46100 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRXP46100 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRXP46100 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRXP46100 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRXP46100 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRXP46100 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRXP46100 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRXP46100 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRXP46100 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRXP46100 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRXP46100 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRXP46100 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRXP46100 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRXP46100 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRXP46100 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATRXP46100 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATRXP46100 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATRXP46100 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATRXP46100 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATRXP46100 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRXP46100 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRXP46100 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRXP46100 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRXP46100 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRXP46100 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRXP46100 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRXP46100 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRXP46100 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRXP46100 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRXP46100 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRXP46100 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRXP46100 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRXP46100 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRXP46100 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRXP46100 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRXP46100 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRXP46100 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRXP46100 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRXP46100 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRXP46100 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRXP46100 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms