Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSR1P43307 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSR1P43307 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SSR1P43307 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSR1P43307 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSR1P43307 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSR1P43307 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR1P43307 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR1P43307 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR1P43307 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR1P43307 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR1P43307 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR1P43307 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR1P43307 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR1P43307 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR1P43307 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR1P43307 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR1P43307 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR1P43307 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSR1P43307 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSR1P43307 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSR1P43307 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSR1P43307 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSR1P43307 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSR1P43307 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSR1P43307 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSR1P43307 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSR1P43307 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSR1P43307 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSR1P43307 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSR1P43307 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSR1P43307 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSR1P43307 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSR1P43307 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSR1P43307 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSR1P43307 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSR1P43307 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSR1P43307 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSR1P43307 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSR1P43307 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR1P43307 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR1P43307 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR1P43307 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR1P43307 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR1P43307 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR1P43307 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR1P43307 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR1P43307 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR1P43307 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR1P43307 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR1P43307 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR1P43307 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR1P43307 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR1P43307 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR1P43307 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR1P43307 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR1P43307 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR1P43307 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR1P43307 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR1P43307 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR1P43307 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR1P43307 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR1P43307 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSR1P43307 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSR1P43307 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSR1P43307 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSR1P43307 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSR1P43307 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSR1P43307 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSR1P43307 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSR1P43307 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR1P43307 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR1P43307 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR1P43307 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR1P43307 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR1P43307 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR1P43307 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR1P43307 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR1P43307 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR1P43307 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR1P43307 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR1P43307 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR1P43307 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR1P43307 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSR1P43307 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSR1P43307 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSR1P43307 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSR1P43307 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSR1P43307 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSR1P43307 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSR1P43307 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSR1P43307 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSR1P43307 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSR1P43307 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSR1P43307 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSR1P43307 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSR1P43307 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSR1P43307 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSR1P43307 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSR1P43307 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms