Protein–RNA interactions for Protein: P38206

RFT1, Oligosaccharide translocation protein RFT1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RFT1P38206 ARG8YOL140W 1272 nt5.16□□□□□ -1.58
RFT1P38206 HNT2YDR305C 654 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 SNA2YDR525W-A 240 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YFL068WYFL068W 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 LPL1YOR059C 1353 nt5.15□□□□□ -1.59
RFT1P38206 RIP1YEL024W 648 nt5.14□□□□□ -1.59
RFT1P38206 PMT2YAL023C 2280 nt5.14□□□□□ -1.59
RFT1P38206 CLF1YLR117C 2064 nt5.14□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YEF1YEL041W 1488 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 ZPR1YGR211W 1461 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 PEX29YDR479C 1665 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 CPR4YCR069W 957 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 CYM1YDR430C 2970 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YKR073CYKR073C 321 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 SAP30YMR263W 606 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 OST3YOR085W 1053 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YER158CYER158C 1722 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 NUP1YOR098C 3231 nt5.13□□□□□ -1.59
RFT1P38206 MSC2YDR205W 2175 nt5.12□□□□□ -1.59
RFT1P38206 BOP2YLR267W 1713 nt5.12□□□□□ -1.59
RFT1P38206 PEP5YMR231W 3090 nt5.12□□□□□ -1.59
RFT1P38206 ARG82YDR173C 1068 nt5.12□□□□□ -1.59
RFT1P38206 ATG33YLR356W 594 nt5.12□□□□□ -1.59
RFT1P38206 MCX1YBR227C 1563 nt5.12□□□□□ -1.59
RFT1P38206 ALG6YOR002W 1635 nt5.12□□□□□ -1.59
RFT1P38206 SIF2YBR103W 1608 nt5.12□□□□□ -1.59
RFT1P38206 CYK3YDL117W 2658 nt5.11□□□□□ -1.59
RFT1P38206 JAC1YGL018C 555 nt5.11□□□□□ -1.59
RFT1P38206 COA3YJL062W-A 258 nt5.11□□□□□ -1.59
RFT1P38206 NMA1YLR328W 1206 nt5.11□□□□□ -1.59
RFT1P38206 SRV2YNL138W 1581 nt5.11□□□□□ -1.59
RFT1P38206 HXT7YDR342C 1713 nt5.1□□□□□ -1.59
RFT1P38206 HXT6YDR343C 1713 nt5.1□□□□□ -1.59
RFT1P38206 NPY1YGL067W 1155 nt5.1□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.1□□□□□ -1.59
RFT1P38206 MAG2YLR427W 2013 nt5.1□□□□□ -1.59
RFT1P38206 VPS72YDR485C 2388 nt5.09□□□□□ -1.59
RFT1P38206 EXO1YOR033C 2109 nt5.09□□□□□ -1.59
RFT1P38206 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.09□□□□□ -1.59
RFT1P38206 REC114YMR133W 1287 nt5.09□□□□□ -1.59
RFT1P38206 DOM34YNL001W 1161 nt5.09□□□□□ -1.59
RFT1P38206 MGR2YPL098C 342 nt5.09□□□□□ -1.59
RFT1P38206 NUP2YLR335W 2163 nt5.09□□□□□ -1.59
RFT1P38206 ARO10YDR380W 1908 nt5.09□□□□□ -1.6
RFT1P38206 IMA1YGR287C 1770 nt5.09□□□□□ -1.6
RFT1P38206 YDL012CYDL012C 324 nt5.08□□□□□ -1.6
RFT1P38206 YIM1YMR152W 1098 nt5.08□□□□□ -1.6
RFT1P38206 YNL019CYNL019C 855 nt5.08□□□□□ -1.6
RFT1P38206 YNL033WYNL033W 855 nt5.08□□□□□ -1.6
RFT1P38206 AIF1YNR074C 1137 nt5.08□□□□□ -1.6
RFT1P38206 UMP1YBR173C 447 nt5.08□□□□□ -1.6
RFT1P38206 ARN2YHL047C 1863 nt5.08□□□□□ -1.6
RFT1P38206 MKC7YDR144C 1791 nt5.08□□□□□ -1.6
RFT1P38206 MNN4YKL201C 3537 nt5.08□□□□□ -1.6
RFT1P38206 VID22YLR373C 2706 nt5.08□□□□□ -1.6
RFT1P38206 ARF2YDL137W 546 nt5.07□□□□□ -1.6
RFT1P38206 YGL185CYGL185C 1140 nt5.07□□□□□ -1.6
RFT1P38206 PDE1YGL248W 1110 nt5.07□□□□□ -1.6
RFT1P38206 CAB4YGR277C 918 nt5.07□□□□□ -1.6
RFT1P38206 TVP38YKR088C 1014 nt5.07□□□□□ -1.6
RFT1P38206 ATG17YLR423C 1254 nt5.07□□□□□ -1.6
RFT1P38206 YNL134CYNL134C 1131 nt5.07□□□□□ -1.6
RFT1P38206 YIF1YNL263C 945 nt5.07□□□□□ -1.6
RFT1P38206 ATM1YMR301C 2073 nt5.07□□□□□ -1.6
RFT1P38206 SPC97YHR172W 2472 nt5.06□□□□□ -1.6
RFT1P38206 CAB3YKL088W 1716 nt5.06□□□□□ -1.6
RFT1P38206 PDR15YDR406W 4590 nt5.06□□□□□ -1.6
RFT1P38206 URA3YEL021W 804 nt5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms