Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms