Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGER1P34995 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER1P34995 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER1P34995 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms