Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCD1P33897 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms