Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCR5P32302 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CXCR5P32302 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms