Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCKBRP32239 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCKBRP32239 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms