Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXA11P31270 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXA11P31270 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms