Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRIP30626 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRIP30626 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRIP30626 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRIP30626 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRIP30626 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRIP30626 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRIP30626 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRIP30626 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRIP30626 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRIP30626 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRIP30626 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRIP30626 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRIP30626 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRIP30626 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRIP30626 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRIP30626 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRIP30626 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRIP30626 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRIP30626 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRIP30626 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRIP30626 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRIP30626 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRIP30626 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRIP30626 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRIP30626 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRIP30626 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRIP30626 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRIP30626 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRIP30626 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRIP30626 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRIP30626 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRIP30626 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRIP30626 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRIP30626 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRIP30626 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRIP30626 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SRIP30626 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRIP30626 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRIP30626 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRIP30626 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRIP30626 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRIP30626 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRIP30626 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRIP30626 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRIP30626 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRIP30626 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRIP30626 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRIP30626 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRIP30626 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRIP30626 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRIP30626 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRIP30626 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRIP30626 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRIP30626 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRIP30626 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRIP30626 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRIP30626 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRIP30626 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRIP30626 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms