Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND2P30279 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND2P30279 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND2P30279 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND2P30279 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND2P30279 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND2P30279 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND2P30279 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND2P30279 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND2P30279 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND2P30279 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND2P30279 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND2P30279 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND2P30279 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND2P30279 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND2P30279 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND2P30279 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND2P30279 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND2P30279 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND2P30279 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND2P30279 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND2P30279 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND2P30279 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND2P30279 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND2P30279 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND2P30279 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND2P30279 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND2P30279 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND2P30279 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND2P30279 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND2P30279 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND2P30279 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND2P30279 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND2P30279 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND2P30279 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND2P30279 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND2P30279 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND2P30279 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND2P30279 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND2P30279 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND2P30279 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND2P30279 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND2P30279 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND2P30279 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND2P30279 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND2P30279 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND2P30279 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND2P30279 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND2P30279 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND2P30279 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND2P30279 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND2P30279 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND2P30279 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND2P30279 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND2P30279 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND2P30279 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND2P30279 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND2P30279 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND2P30279 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND2P30279 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND2P30279 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND2P30279 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND2P30279 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND2P30279 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND2P30279 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCND2P30279 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCND2P30279 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCND2P30279 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCND2P30279 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCND2P30279 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCND2P30279 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND2P30279 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND2P30279 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND2P30279 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND2P30279 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND2P30279 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND2P30279 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND2P30279 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND2P30279 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND2P30279 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND2P30279 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND2P30279 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND2P30279 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND2P30279 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND2P30279 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND2P30279 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND2P30279 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND2P30279 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCND2P30279 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCND2P30279 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCND2P30279 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCND2P30279 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCND2P30279 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCND2P30279 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCND2P30279 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCND2P30279 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCND2P30279 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCND2P30279 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCND2P30279 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCND2P30279 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms