Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EPHA3P29320 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms