Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD38P28907 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD38P28907 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD38P28907 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD38P28907 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD38P28907 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD38P28907 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD38P28907 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD38P28907 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD38P28907 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD38P28907 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD38P28907 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD38P28907 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD38P28907 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD38P28907 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD38P28907 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD38P28907 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD38P28907 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD38P28907 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD38P28907 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD38P28907 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD38P28907 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD38P28907 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD38P28907 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD38P28907 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD38P28907 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD38P28907 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD38P28907 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD38P28907 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD38P28907 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD38P28907 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD38P28907 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD38P28907 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD38P28907 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD38P28907 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD38P28907 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD38P28907 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD38P28907 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD38P28907 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD38P28907 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD38P28907 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD38P28907 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD38P28907 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD38P28907 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD38P28907 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD38P28907 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD38P28907 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD38P28907 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD38P28907 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD38P28907 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD38P28907 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD38P28907 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD38P28907 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD38P28907 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD38P28907 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD38P28907 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD38P28907 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD38P28907 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD38P28907 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD38P28907 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD38P28907 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD38P28907 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD38P28907 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD38P28907 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD38P28907 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD38P28907 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD38P28907 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD38P28907 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD38P28907 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD38P28907 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD38P28907 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD38P28907 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD38P28907 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD38P28907 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD38P28907 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD38P28907 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD38P28907 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD38P28907 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD38P28907 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD38P28907 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CD38P28907 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD38P28907 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD38P28907 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD38P28907 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD38P28907 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD38P28907 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD38P28907 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms