Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD27P26842 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD27P26842 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD27P26842 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD27P26842 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD27P26842 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD27P26842 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD27P26842 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD27P26842 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CD27P26842 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CD27P26842 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CD27P26842 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CD27P26842 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD27P26842 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CD27P26842 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD27P26842 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD27P26842 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD27P26842 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD27P26842 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD27P26842 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD27P26842 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD27P26842 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD27P26842 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD27P26842 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD27P26842 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD27P26842 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD27P26842 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD27P26842 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD27P26842 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD27P26842 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD27P26842 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD27P26842 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD27P26842 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD27P26842 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD27P26842 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CD27P26842 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD27P26842 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CD27P26842 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CD27P26842 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD27P26842 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD27P26842 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD27P26842 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD27P26842 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD27P26842 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD27P26842 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD27P26842 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD27P26842 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD27P26842 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD27P26842 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD27P26842 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD27P26842 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD27P26842 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD27P26842 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD27P26842 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD27P26842 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD27P26842 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD27P26842 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD27P26842 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD27P26842 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD27P26842 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD27P26842 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD27P26842 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD27P26842 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD27P26842 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD27P26842 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD27P26842 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD27P26842 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD27P26842 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD27P26842 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD27P26842 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD27P26842 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD27P26842 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms