Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMGB2P26583 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMGB2P26583 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMGB2P26583 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms