Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTFP26441 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTFP26441 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTFP26441 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTFP26441 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTFP26441 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTFP26441 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTFP26441 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTFP26441 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTFP26441 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTFP26441 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTFP26441 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTFP26441 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTFP26441 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTFP26441 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTFP26441 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTFP26441 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTFP26441 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTFP26441 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTFP26441 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTFP26441 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTFP26441 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTFP26441 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTFP26441 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTFP26441 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTFP26441 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTFP26441 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTFP26441 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTFP26441 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTFP26441 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTFP26441 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTFP26441 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTFP26441 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTFP26441 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTFP26441 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTFP26441 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTFP26441 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTFP26441 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTFP26441 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTFP26441 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTFP26441 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTFP26441 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTFP26441 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTFP26441 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTFP26441 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTFP26441 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTFP26441 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTFP26441 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTFP26441 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTFP26441 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTFP26441 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTFP26441 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTFP26441 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTFP26441 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTFP26441 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTFP26441 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTFP26441 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTFP26441 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTFP26441 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTFP26441 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTFP26441 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTFP26441 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTFP26441 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTFP26441 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTFP26441 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTFP26441 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTFP26441 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTFP26441 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTFP26441 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTFP26441 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTFP26441 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTFP26441 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTFP26441 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTFP26441 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTFP26441 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTFP26441 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTFP26441 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTFP26441 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTFP26441 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTFP26441 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTFP26441 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTFP26441 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTFP26441 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTFP26441 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTFP26441 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTFP26441 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTFP26441 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTFP26441 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTFP26441 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTFP26441 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTFP26441 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTFP26441 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTFP26441 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTFP26441 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTFP26441 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTFP26441 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTFP26441 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTFP26441 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTFP26441 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTFP26441 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms