Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTAFRP25105 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTAFRP25105 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms