Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX7P23759 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX7P23759 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX7P23759 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX7P23759 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX7P23759 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX7P23759 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX7P23759 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX7P23759 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX7P23759 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX7P23759 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX7P23759 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX7P23759 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX7P23759 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX7P23759 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX7P23759 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX7P23759 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX7P23759 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX7P23759 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX7P23759 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX7P23759 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX7P23759 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX7P23759 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX7P23759 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX7P23759 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX7P23759 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX7P23759 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX7P23759 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX7P23759 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX7P23759 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX7P23759 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAX7P23759 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAX7P23759 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAX7P23759 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX7P23759 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX7P23759 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX7P23759 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX7P23759 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX7P23759 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX7P23759 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX7P23759 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX7P23759 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX7P23759 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX7P23759 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX7P23759 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX7P23759 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX7P23759 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX7P23759 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX7P23759 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX7P23759 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX7P23759 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX7P23759 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX7P23759 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX7P23759 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX7P23759 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX7P23759 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX7P23759 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX7P23759 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX7P23759 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX7P23759 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX7P23759 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX7P23759 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX7P23759 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX7P23759 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX7P23759 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX7P23759 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX7P23759 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX7P23759 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX7P23759 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX7P23759 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX7P23759 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX7P23759 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX7P23759 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX7P23759 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX7P23759 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX7P23759 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX7P23759 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX7P23759 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX7P23759 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX7P23759 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX7P23759 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX7P23759 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX7P23759 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX7P23759 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX7P23759 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX7P23759 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX7P23759 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX7P23759 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX7P23759 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX7P23759 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX7P23759 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX7P23759 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX7P23759 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX7P23759 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PAX7P23759 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PAX7P23759 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX7P23759 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX7P23759 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX7P23759 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX7P23759 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms